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AI顯微鏡問世,數(shù)清血液中瘧疾細(xì)菌的數(shù)量不在話下
  • 發(fā)布日期:2017-11-15      瀏覽次數(shù):849
    • 比爾蓋茨的投資公司和中國(guó)麥克奧迪公司今天聯(lián)合宣布,計(jì)劃推出一款深度學(xué)習(xí)顯微鏡,該顯微鏡能夠在 20 分鐘之內(nèi)自動(dòng)分辨和計(jì)算血液樣本中瘧疾細(xì)菌的數(shù)量。每年*約有50多萬(wàn)人死于這種由蚊子傳播的疾病,這種AI顯微鏡可以加速并標(biāo)準(zhǔn)化瘧疾的檢測(cè)流程。

      圖 | 研究員 Roxanne Rees-Channer 正在測(cè)試 EasyScan GO 顯微鏡

      AI顯微鏡的實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,它檢測(cè)瘧疾寄生蟲的能力達(dá)到了zui高的世界衛(wèi)生組織顯微鏡標(biāo)準(zhǔn)(等級(jí))。這個(gè)評(píng)級(jí)意味著它可以與訓(xùn)練有素的顯微鏡專家不分伯仲,盡管有研究人員指出,一些專業(yè)的顯微鏡技術(shù)人員仍然可以勝過自動(dòng)化系統(tǒng)。

      今年十月 Computer Vision 大會(huì)上的一項(xiàng)研究啟發(fā)了中國(guó)的麥克奧迪顯微鏡公司和 Global Good Fund(高智公司和比爾蓋茨共同投資的基金會(huì)),兩者決定共同實(shí)現(xiàn)顯微鏡技術(shù)的商業(yè)化。

      這種顯微鏡非常有助于跟蹤治療東南亞瘧疾中的多重耐藥菌株。Global Good Fund 健康技術(shù)主任 David Bell 表示:“這種多重耐藥菌株的監(jiān)測(cè)依賴于非??煽康娘@微鏡,幫助人們了解瘧疾藥物的效果,以及血液中寄生蟲數(shù)量的減少速度。我們發(fā)現(xiàn)機(jī)器學(xué)習(xí)可以讓這個(gè)過程更加和標(biāo)準(zhǔn),從而讓很多國(guó)家實(shí)現(xiàn)更有效的監(jiān)測(cè)。”

      Global Good Fund 在于德國(guó)杜塞爾多夫舉辦的 MEDICA 2017 展會(huì)上公布了一部分細(xì)節(jié),該大會(huì)的舉辦時(shí)間為 2017 年 11 月 13 日至 16 日。正在研發(fā)的 EasyScan GO 顯微鏡將結(jié)合明場(chǎng)顯微鏡技術(shù)和深度學(xué)習(xí)軟件,該軟件可以自動(dòng)識(shí)別導(dǎo)致瘧疾的寄生蟲。工作人員將大部分注意力放在制備血液樣本玻片上,以及在顯微鏡下觀察并驗(yàn)證結(jié)果。

      高智公司主要調(diào)查員 Ben Wilson 表示,深度學(xué)習(xí)算法通常需要大量的訓(xùn)練數(shù)據(jù)來準(zhǔn)確識(shí)別物體,然而瘧疾寄生蟲為深度學(xué)習(xí)算法“準(zhǔn)備”了一個(gè)棘手的“稀有物體問題”。在血液涂片的數(shù)百個(gè)顯微鏡圖像中,微小的瘧疾寄生蟲可能僅顯示幾次。

      在感染水平非常低的情況下,10萬(wàn)個(gè)紅細(xì)胞中可能只有1個(gè)瘧疾寄生蟲。麥克奧迪公司總 Sebastian Nunnendorf 表示,“這就像是在標(biāo)準(zhǔn)尺寸的足球場(chǎng)上尋找彈珠一樣。”

      他們的解決方案是將深度學(xué)習(xí)和用于分割圖像中敏感信息的傳統(tǒng)計(jì)算機(jī)算法相結(jié)合,而這還需要大量顯微鏡載玻片的培訓(xùn)數(shù)據(jù)。Wilson 和他的同事甚至要求幾個(gè)實(shí)驗(yàn)室故意準(zhǔn)備一些質(zhì)量差的載玻片,以便訓(xùn)練深度學(xué)習(xí)算法在不理想的情況下也能完成工作。“就顯微鏡領(lǐng)域的機(jī)器學(xué)習(xí)而言,檢測(cè)瘧疾和傳染病的手段是相當(dāng)*的”,Wilson 補(bǔ)充道。

      圖 | Global Good 研究員在使用 EasyScan GO 顯微鏡

      EasyScan GO 的原型顯微鏡掃描每個(gè)載玻片的速度大約與人類顯微鏡專家相當(dāng),每片 20 分鐘。但 Wilson 預(yù)計(jì),zui終能夠?qū)呙钑r(shí)間縮短一半,每片只需 10 分鐘。更重要的是,現(xiàn)有的原型顯微鏡也可以用來輔助數(shù)量有限的顯微鏡專家,幫助他們確定瘧疾和追蹤多重耐藥性瘧疾。麥克奧迪公司總 Nunnendorf 表示,“本質(zhì)上來講這是巨大的工作效率提升,而不是單純的機(jī)器替換人類。”

      如果 EasyScan GO 顯微鏡能夠大規(guī)模普及,它們也可以讓監(jiān)測(cè)傳染病傳播和藥物治療效果的研究人員受益。因?yàn)?AI 顯微鏡可以提供標(biāo)準(zhǔn)化的檢測(cè)結(jié)果,可以在不同地區(qū)之間進(jìn)行多年數(shù)據(jù)的直接比較。

      深度學(xué)習(xí)算法的早期測(cè)試依賴于特殊定制的顯微鏡硬件。Global Good 的研究人員目前正在與 Motic 合作,以確保 EasyScan GO 顯微鏡的量產(chǎn)版本仍然可以滿足世界衛(wèi)生組織顯微鏡專家的zui高標(biāo)準(zhǔn)。

      公司推出的zui終價(jià)格和上市時(shí)間尚未確定,但是 Global Good 和麥克奧迪預(yù)計(jì)其價(jià)格比較接近基本型顯微鏡,而不是昂貴的數(shù)字載玻片掃描儀??刂瞥杀緦?duì)于顯微鏡的普及十分關(guān)鍵,許多努力防治瘧疾和其他傳染病蔓延的國(guó)家并不富裕。Nunnendorf 表示,“為了能zui大化防治瘧疾,定價(jià)一定要特別適合低收入和中等收入國(guó)家。”

      圖 | 顯微鏡原型機(jī)內(nèi)部

      Motic 還計(jì)劃更新 EasyScan GO 的系統(tǒng)軟件,使其“學(xué)會(huì)”診斷登革熱,南美錐蟲病,微絲蚴和鐮狀細(xì)胞貧血等其他疾病。該計(jì)劃將建立在深度學(xué)習(xí) AI 能夠準(zhǔn)確識(shí)別瘧疾寄生蟲的成功上。

      Nunnendorf 總結(jié)道,“瘧疾是zui難以確定的疾?。ㄖ唬俏覀冏龅搅?。未來我們計(jì)劃拓展到其他明視場(chǎng)顯微鏡任務(wù),包括血液膜上常見的寄生蟲和性狀,并且拓展檢測(cè)樣本類型,包括痰和糞便。這種成功給我們鋪平了未來的道路。”(生物谷Bioon.com)

      參考:

      https://spectrum.ieee.org/the-human-os/robotics/artificial-inligence/aipowered-microscope-counts-malaria-parasites

    魏經(jīng)理
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