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GE新平臺蛋白質(zhì)實驗研究減少誤差
導(dǎo)讀:GE Healthcare的Amersham WB系統(tǒng)集成了標準化的Western blot實驗流程,包括電泳、轉(zhuǎn)印、印跡和成像分析功能,有望大大減少實驗中的差異,帶來一致的、定量的蛋白質(zhì)分析結(jié)果。這臺*一體化的系統(tǒng)由GE Healthcare位于瑞典烏普薩拉的蛋白科學(xué)中心實驗室研發(fā),在2014年底上市。
Western blot雖然是蛋白質(zhì)研究中zui常用的技術(shù)之一,但想說愛它也不容易。這是一項非常不確定的技術(shù)。有時,忙上一天,zui后什么結(jié)果也沒有。有時,結(jié)果挺好,但再也重復(fù)不了。據(jù)統(tǒng)計,Western blot的實驗差異性高達35-45%。這使得人們陷入了深深的憂慮:如何才能讓W(xué)estern blot的結(jié)果更加一致呢?
如今,這個問題有了一個很好的答案。GE Healthcare的Amersham WB系統(tǒng)集成了標準化的Western blot實驗流程,包括電泳、轉(zhuǎn)印、印跡和成像分析功能,有望大大減少實驗中的差異,帶來一致的、定量的蛋白質(zhì)分析結(jié)果。這臺*一體化的系統(tǒng)由GE Healthcare位于瑞典烏普薩拉的蛋白科學(xué)中心實驗室研發(fā),在2014年底上市。
Amersham WB由主機、軟件和專屬耗材組成。Amersham WB主機(圖1)包括兩部分:電泳掃描單元(左)和印跡單元(右)。電泳掃描單元主要負責(zé)SDS-PAGE以及凝膠或膜成像;而印跡單元則用于轉(zhuǎn)印、雜交孵育和干燥。
有了Amersham WB系統(tǒng),Western blot實驗可在4小時之內(nèi)完成,而無需一整天的漫長等待。無論你是開展傳統(tǒng)的單色分析,還是定量的雙通道分析,它都能搞定。下面我們就來看看Amersham WB系統(tǒng)是如何帶來一致結(jié)果的。
第1步:電泳(42分鐘)
在這一步中,電泳裝置能夠在恒定溫度下提供高度均一的電流,再加上標準化的試劑和耗材,Amersham WB系統(tǒng)大大提高聚丙烯酰胺凝膠電泳的一致性。Amersham WB預(yù)制膠優(yōu)化了濃縮膠和分離膠的區(qū)域,可帶來出色的分辨率;而配套的電泳緩沖液條取代了液體緩沖液,使用方便且重復(fù)性好。這些特征讓電泳步驟的變化降至zui低程度,產(chǎn)生了容易定量和分析的條帶。
GE Healthcare還提供了Amersham WB Cy5總蛋白標記試劑,可以很容易地預(yù)標記蛋白質(zhì),這樣在電泳后無需染色即可直接檢測總蛋白。利用Cy5總蛋白信號歸一化目標信號,可以校正上樣誤差,而無需預(yù)先定量。
第2步:轉(zhuǎn)印(30分鐘)
從制作三明治,到蛋白質(zhì)從凝膠轉(zhuǎn)移到膜上,所有關(guān)鍵的參數(shù)和組件都經(jīng)過標準化,有利于帶來*的結(jié)果和zui低的背景。Amersham WB PVDF卡設(shè)計巧妙,可避免用戶誤操作,而濾紙也已經(jīng)切好,配合轉(zhuǎn)印架的設(shè)計,減少出錯的可能。在關(guān)閉轉(zhuǎn)印架時,內(nèi)置的滾筒可以去除氣泡,增加重現(xiàn)性。內(nèi)置的冷卻也能保持恒定的溫度,避免過熱。
有了這一系列的措施,轉(zhuǎn)印也能夠高度重現(xiàn),而不再需要擔(dān)心實驗間的差異。同時,你也不需要一次又一次地重復(fù)實驗,從而節(jié)省時間,節(jié)省經(jīng)費。
第3步:雜交(155分鐘)
大家都知道,一抗很珍貴,因此都在想方設(shè)法少用一點。Amersham WB系統(tǒng)也能滿足你的這個愿望。系統(tǒng)的高靈敏度以及步驟和組件的優(yōu)化意味著你zui多能節(jié)省50%的一抗。此外,一抗也能回收,用在后續(xù)的實驗中。生物通 www.ebiotrade。。com
封閉、洗滌、一抗和二抗孵育,這些繁瑣的操作都由系統(tǒng)自動完成,而你所要做的只是加入一抗、二抗、封閉液和洗滌液,然后按下Start按鈕。之后,你就可以抽身去做其他的事,或者去吃飯。不放心的話,還能通過手機上的Amersham WB Watch app來遠程監(jiān)控實驗過程。
第4步:檢測和成像(15分鐘)
低熒光背景的PVDF卡,經(jīng)過優(yōu)化的熒光標記試劑,以及高性能的激光掃描儀,這些帶來了高質(zhì)量的定量數(shù)據(jù)。因此,你可以靈敏檢測蛋白豐度的微小變化,分離和比較磷酸化與非磷酸化蛋白,并在同一塊印跡上準確測定高豐度和低豐度蛋白。
德國癌癥研究中心的Martin Teichert談道:“因為它的動態(tài)范圍很寬,所以不再有傳統(tǒng)ECL的所有限制。突然,我們就能比較之前無法比較的樣品。"
第5步:分析(1-2分鐘)
對于數(shù)據(jù)分析而言,軟件的方便好用至關(guān)重要。掃描一結(jié)束,Amersham WB軟件自動開展數(shù)據(jù)分析,通過柱狀圖、泳道圖和表格顯示關(guān)鍵信息。它能顯示所選擇泳道和條帶檢測結(jié)果,定量目標蛋白相對雜質(zhì)的百分比,并利用總蛋白或內(nèi)參蛋白來歸一化目標蛋白的信號。在你滿意了分析結(jié)果之后,也能輕松導(dǎo)出這些可立即發(fā)表的圖像和數(shù)據(jù)。
此外,Amersham WB軟件也提供多種應(yīng)用的標準化實驗方案,比如蛋白組成和豐度的快速篩選,比較樣品間蛋白質(zhì)水平的定量分析。屏幕左側(cè)顯示正在運行的項目和參數(shù),如有必要,可在屏幕右側(cè)修改實驗方案的默認參數(shù)。在整個Western blot過程中,大多數(shù)操作由儀器自動完成,你只需要做少量的準備工作,這個可以讓手機上的Amersham WB Watch app提醒你。
現(xiàn)在,你不再擔(dān)心Western blot的結(jié)果像*了吧。通過這臺智能的儀器,專屬的耗材和精心優(yōu)化的實驗方案,你可以獲得更加定量、更容易重現(xiàn)的Western blot數(shù)據(jù)。這樣,你就能少一些重復(fù),少一些優(yōu)化,也少一些troubleshooting。關(guān)鍵是,對結(jié)果更有信心。
(來源:生物通)