DNA提取生物磁珠屬于生物生物磁珠的一種,其中心為氧化鐵內(nèi)核,中層包裹封閉基質,外層修飾官能團。應用于DNA吸附與提取純化的領域,具有一些重要的參數(shù)要求,如半沉降時間,磁吸時間,粒徑,比表面積,表面官能團密度等。參數(shù)的差異不僅會導致操作復雜程度的不同,更會導致提取結果的不同,我們在選擇DNA提取生物磁珠的時候,更要注重參數(shù)的區(qū)別,以下4種參數(shù)是選擇DNA提取生物磁珠的有效參考。
1、懸浮性
DNA提取生物磁珠雖然具有一定的流動性,能夠均勻分散在液體中,跟隨液相進入實驗體系,但生物磁珠畢竟還是固體,會在液體中以一定速度沉降。所以DNA提取生物磁珠的半沉降時間應在2min以上,才能保證加入生物磁珠時不會因為沉降過快而導致加入量不準確,如果是多樣本的操作,對生物磁珠的半沉降時間要求應該更高。生物磁珠良好的懸浮性,可以在操作過程中不用頻繁混勻生物磁珠,方便快捷的同時增加了實驗的穩(wěn)定性和均一性。
2、磁吸時間
DNA提取生物磁珠攜帶目的DNA與體系中雜質分離的過程,主要是通過外加磁場使生物磁珠定向移動并達到固液分離的目的,所以生物磁珠的磁吸時間會影響固液分離的時間,有些品牌的生物磁珠磁吸速度特別慢,這就影響了整體實驗效率。DNA提取生物磁珠,磁吸時間均小于30s,適應手動和儀器操作進行核酸純化的實驗頻率。
3、比表面積
部分使用DNA提取生物磁珠的實驗人員認為粒徑越小的生物磁珠比表面積越大吸附效果也越好,這種想法并不*正確。因為生物磁珠表面并不是光滑平整的球面,而是在中間基質層有孔洞,外圍修飾集團有凸起的,比表面積并不由粒徑大小決定,而且也并不是比表面積越大吸附效果就越好的。有研究表明,當比表面積在60m2/g時,對核酸的吸附效果較好。粒徑在300nm左右的生物磁珠包被基質層薄內(nèi)陷孔洞少,孔容孔徑低;粒徑在1um左右的生物磁珠包被基質層厚,表面有大量孔洞,兩者比表面積都可以達到60m2/g左右。
4、官能基團
一般認為DNA提取生物磁珠表面官能團能越密集,對DNA的吸附效果越好,但考慮到空間位阻、電荷斥力,過高濃度使官能團陷入生物磁珠內(nèi)部等原因,DNA提取生物磁珠的表面官能團數(shù)量并不是越多越好的。適當?shù)慕档蜕锎胖樯a(chǎn)過程中官能團修飾原料,可以很好的控制DNA提取生物磁珠的粒徑和吸附量平衡。