實驗步驟 | 一、材料
1. 緩沖液、溶液和試劑
溴化乙錠
Taq 延伸 PCR 添加劑(Stratagene)
Tween20,10% 溶液
2. 酶和酶緩沖液
dNTP 溶液(包含所有的 4 種 dNTP,每種都是 25 mmol/L)
PCR 緩沖液,10X, 用戶買熱穩(wěn)定聚合酶時公司一并提供,或者 PCR 優(yōu)化緩沖液,比如,Opti-Prime PCR 優(yōu)化試劑盒(Stratagene),以及 PCR Optimizer(Invitrogen)
熱穩(wěn)定 DNA 聚合酶(5~10U),比如,Taq DNA 聚合酶,克隆化的 Pfu DNA 聚合酶(Stratagene)
3. 核酸和寡核苷酸
可選擇:插入物特異的引物(在雙向克隆中用來確定插入物的方向)
一套篩選重組體的引物
4. 設備
用于劃板和接菌的無菌槍頭
用槍頭代替牙簽,是因為牙簽可通過毛細作用帶走液體,因此會改變反應混合物的濃度。
5. 額外項目
瓊脂糖凝膠電泳設備和試劑,包括溴化乙錠
二、方法
1. 根據反應數目或要做的 PCR 反應的管數,在冰上用一個離心管像調雞尾酒一樣準備
PCR「雞尾酒」式混合物,按如下順序依次加入各種成分。
H2O 將終體積補充到 25ul
Taq 緩沖液,10X 2.5ul
Tween20(體積分數 10% 溶液) 1.0ul
dNTP 混合物(每種 dNTP 為 25 mmol/L) 0.2ul
重組體篩選引物套(100ng/ul) 1ul
Taq 延伸 PCR 添加劑(5U/ul) 0.25ul
Taq DNA 聚合酶(5U/ul) 0.25ul
2. 在冰上,分裝"雞尾酒"式 PCR 混合物到每一個 PCR 試管中,每管移取 25ul。
3. 對照反應中,加入 1ul 的非重組 DNA。 可以選擇:對于用來確定插入方向的反應,向恰當的反應管中加入第三個插入物特異的引物。
4. 對于重組篩選,用一個無菌槍頭刺挑一下轉化后長出的菌落,然后在相應的反應管中攪動菌落物質。在給每一個反應混合物接種后,迅速地移走槍頭,并在含有抗生素平板上輕涂以留菌種,以備后續(xù)分析。對于 PCR 介導的重組篩選,也可參考下面的疑難解答。
5. 輕輕混勻每個反應體系。
6. 用推薦的循環(huán)參數進行 PCR。
7. 用標準的瓊脂糖凝膠電泳分析 PCR 產物。推薦用 10~15 g/L 瓊脂糖凝膠來優(yōu)化分辨500~6000bp 的 PCR 產物。通常,取 1~5ul PCR 產物經溴化乙錠染色后分析??梢酝ㄟ^傳統(tǒng)的瞬間成像技術或計算機圖像軟件來獲取圖像。 |
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