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細(xì)胞類代謝組學(xué)樣本收集步驟
  • 發(fā)布日期:2018-03-02      瀏覽次數(shù):4757
    • 適用細(xì)胞類型:哺乳動(dòng)物細(xì)胞(CHO、NS0、CD-hybridoma 細(xì)胞系)

      樣品量要求: 
      1*10 7 cell/sample,提供 2 份樣本。  

      樣本收集步驟:

      1) 使用細(xì)胞計(jì)數(shù)器測(cè)定細(xì)胞數(shù)量,計(jì)算出所需淬滅緩沖液的量。下圖以細(xì)胞數(shù)量1*10 7 為例; 
      NOTE:①使用50ml圓錐形管一次處理樣本zui大量為8ml,如果樣本量>8ml,就分開做;②淬滅過(guò)程時(shí)間敏感,兩個(gè)人操作。 

      2) 將 5 倍樣本體積的淬滅緩沖液加入 50ml 圓錐形管中;

      3) 在低溫恒溫器上預(yù)冷淬滅緩沖液至-40℃ (淬滅緩沖液:60%(v/v)甲醇+0.85%(wt/v)碳酸氫銨(pH7.4,使用 12M 的鹽酸進(jìn)行 pH 調(diào)節(jié))。如果沒有低溫恒溫器,可以使用干冰代替,并用低溫溫度計(jì)檢測(cè)溫度,保證每管都處于-40℃,溫度不能過(guò)低); 
      NOTE: 由于單人操作,zui多 2 樣本/次,雙人操作,4 樣/次。保證淬滅處理迅速。因?yàn)闀r(shí)間要求“迅速”。 

      4) 吸取 1 體積的細(xì)胞樣本(1*10 7 ),加入到盛有淬滅緩沖液的管中央。 NOTE: 溫度必須維持在-40℃左右,低于 45℃時(shí),會(huì)導(dǎo)致細(xì)胞破碎。

      5) 緩慢搖晃管子,混勻。 
      NOTE: 禁止 Vortex 渦旋震蕩混勻!

      6) 1000g 離心 1min; 

      7) 去除上清。NOTE:當(dāng)上清被去除干凈后,繼續(xù)貼壁吸取 5s 以保證上清*被去除,因?yàn)橛行┥锨逭吃诒谏希芈涞脑?,?huì)對(duì)后繼操作帶來(lái)負(fù)面影響。

      8) 使用 200μl -80℃的甲醇將細(xì)胞重懸,并轉(zhuǎn)移到 1.5ml 的離心管中,然后用液氮冰凍;

      9) -80 度凍存。足量干冰寄送。  

      注意事項(xiàng): 

      1)淬滅緩沖液 pH 值要在每次適用前重新測(cè)定調(diào)整。

      2)溫度要控制好,強(qiáng)烈建議使用-40℃冰柜操作。  

      參考文獻(xiàn): 
      Sellick C A, Hansen R, Stephens G M, et al. Metabolite extraction from suspension-cultured mammalian cells for global metabolite profiling.[J]. Nature Protocol, 2011, 6(8):1241-9.

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